1．重视脾胃

孙氏妇科崇尚东垣的脾胃学说，李东垣《脾胃论》云：“百病皆由脾胃衰而生也。”又云：“夫脾胃不足皆为血病。”妇女以血为本，血之化源在脾，且冲脉隶属阳明，阳明为多气多血之腑 ，脾胃健旺，精微充足，血气旺盛，冲任充沛，则无以病生。因此，临床上以补脾升阳，治因脾气虚弱引起的月经过多、月经先期、崩漏及胎漏下血、乳汁自溢等证，俾脾气健旺，统摄守职，血以归经。以健运中土治疗因气血化源不足引起的月经后期、经闭、乳汁过少等症，滋其化源，充其血气，冲任得养，经脉畅通，则病自瘥。以和降胃气治疗因胃失和降引起的妊娠恶阻症，其和胃又贯穿于健脾之中，则中气调和，升降有节，病症渐除。

孙氏在临证用药上善护脾胃正气，正如古云“有一分胃气，便有一分生机” 。治疗慢性疾病，注意健护脾胃，滋其化源，俾体质恢复，正气强盛，力以抗邪；治疗急性病，热邪壅盛，不宜久用大苦大寒之药，用量不宜过重，中病即止，若需久用，则必须配伍保护胃气之药，以免胃气损伤并发他病。且补血之药多属厚味腻滞，易碍胃满中，令脾气更虚，败伤胃气，不但血虚难复，且使百病难治，因此常佐以轻量之辛香理气药如陈皮、半夏、木香、砂仁之类，以醒脾开胃。

2．善调气血

盖妇女气血失调常与妇科疾病互为因果，其病理变化必影响冲任二脉而发病。因此，治疗时务使气血调和，冲任通畅。孙氏根据气血机理及临床实践，提出“治血分病当调气为先”的观点。东垣曾云：“凡治杂病，若血受病，亦先调气……。”孙氏治病强调寓调气于理血之中，俾气机调和，血脉畅通，则病自愈。如月经不调，虽是血分病，但因“血之行止与顺逆，皆由气率而行”，故调经之法，以通调气机，行气开郁为先。调理气血之法，依据临床辨证结果而定。如治疗因元气亏虚、血行无力、脉络瘀滞引起的闭经、痛经、经少、乳汁不行、产后身痛等证，应予益气和活血并用，气旺则脉通血行。治疗因血虚导致的月经稀少、闭经、产后缺乳等症，则以益气养血，气旺血生，病患自除。治疗因气虚而致的出血症，以补气摄血为主，气旺则能统血摄血。治疗因肝气郁结，血脉瘀滞所致痛经、经闭、产后腹痛等症，则用疏肝气以散血之法。由于妇女血常不足，故用理气药时不宜过于香燥，以免伤耗阴血，常佐益血之品。

3．补肾固冲

   《傅青主女科》 谓“经本于肾” 、“经水出诸肾” 。《素问·上古真言论》亦曰：“肾者，主水，受五脏六腑之精而藏之。” 孙氏认为，大凡久病大病“穷必及肾” ，临床诸虚不足，多责之于肾，而肾病必以虚为主；“冲为血海” ，为“十二经之海” ，广聚脏腑之血，“任主胞胎”为“阴脉之海” ，而任通冲盛以肾气盛为前提，故冲任之本在于肾。因此，孙氏强调，补肾固冲是治疗妇科疾病重要方法之一，也是善后调理恢复机体功能必备手段。

4．明辨标本

妇科疾病有别于他科，有经、带、胎、产、乳及杂病的特性，病理变化往往错综复杂，孙氏从明辨标本以审虚实凶吉，断主次缓急而分步论治，如此临症则能稳操胜券，化险为夷。妇科疾病的治疗，首先当循从“治病必求于本”的原则，根据疾病的发展过程，还须掌握“急则治标，缓则治本”和“标本同治”要则，灵活进行分步论治。分辨标本为确定治疗提供重要依据，掌握疾病的本质所在，有的放矢，体现辨证求因、审因论治的治病法则。如产育血崩之际，气随血脱，遵《素问·标本病传论》：“病发而不足，标而本之，先治其标，后治其本” 。 “标本同治”临床亦常用之，适用于病势缓和，病程较长，或病情复杂的疾病。如治因脾虚气滞，胃失和降而致的恶阻，方用香砂六君汤以补脾理气，止呕安胎。孙坦村擅以益气养血与祛瘀消癥并用或分步交替运用治疗子宫肌瘤，多获良效，此皆为标本同治。